《萌力全开神箭少女出击》讲述了一群拥有特殊射箭能力的少女们，在一个融合现代科技与魔法元素的世界里，为守护家乡和平而奋勇作战的故事。故事发生在一个名为“灵弓大陆”的虚构世界，这里因神秘能量“萌力”而诞生了众多拥有超凡箭术的神箭少女，她们被赋予了守护世界的重要使命。
剧情围绕主角小鹿樱展开，她是一个天真活泼但射箭初心坚定的少女。随着她逐步觉醒强大的萌力，她加入了“神箭守护团”，与其他性格迥异、能力各异的少女们并肩作战。她们共同面对邪恶势力“暗影联盟”的进攻，解开灵弓大陆隐藏的古老秘密。在不断的挑战与成长中，少女们的羁绊日益深厚，逐渐学会了信任与团队合作的重要性。
故事的高潮发生在暗影联盟发动大规模侵袭，试图夺取萌力源泉以实现统治全大陆的野心。小鹿樱和伙伴们挺身而出，展开了一场惊心动魄的终极战役。最终，凭借坚定的信念和无懈可击的团队配合，她们成功击败敌人，守护了家园的和平。结尾展现少女们成长的自信与萌力的无限可能，预示着她们新的冒险征程即将开启。